در حال حاضر از کشور ایران تعداد 12 دانشگاه و موسسه علوم پزشکی در نظام رتبه بندی ESI واجد رتبه هستند.

مبنای این رتبه‌‌بندی گردآوری و تجزیه و تحلیل اطلاعات یک درصد مقالات دارای بیشترین استنادات در پایگاه ISI Web of Sciences  در فاصله ده ‌سال و هشت ماه ژانویه 2006 تا پایان آگوست 2016 بوده که اطلاعات آن هر دوماه یکبار روزآمد می‌شود.

لازم به ذکر است که در ویرایش اخیر، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان نیز برای اولین بار به جمع دانشگاه‌های برتر کشور در نظام رتبه‌بندی ESI پیوسته است.