همانطور که مستحضريد اين نظام رتبه بندی به ارزيابی حضور پژوهشی و آموزشی دانشگاهها در وب از طريق وب سايتهای دانشگاهی آنان می پردازد. براين اساس وب سايت دانشگاهها و مراکز تحقيقاتی براساس چهار شاخص:  تعداد صفحات وب دانشگاه در گوگل (Presence ) با وزن 5 %، تعداد ارجاع يا لينکهای برقرارشده از ساير سايتها به سايت دانشگاه (شاخص Visibility ) با وزن 50 %، تعداد استنادات ده نويسنده پراستناد دانشگاه در Google Scholar Citations(شاخص Openness ) با وزن 10 % و تعداد مقالات کيفی دانشگاه قرارگرفته در بين 10 % مقالات پراستناد موضوع مربوطه در سايت SCImago (شاخص Excellence ) با وزن 35 % ارزيابی و رتبه بندی می شوند. در رتبه بندی اخير سه دانشگاه علوم پزشکی تهران، شهيد بهشتی و مشهد به ترتيب رتبه های اول تا سوم کشوری را در گروه علوم پزشکی کسب نموده اند. نتايج اخير که در آدرس http://www.webometrics.info نيز موجود است، رتبه 50 دانشگاه علوم پزشکی کشور را در اين نظام رتبه بندی مشخص می کند. لازم به ذکر است که اين نسخه اوليه ويرايش ژانويه 2018 بوده و مطابق روال سالهای قبل، امکان تغيير و اصلاح برخی رتبه ها در نسخه دوم آن وجود دارد.